畠谷山晴岸院覚念寺は関東二十四輩二十三番の旧跡であり、宗祖親鸞聖人の直弟、唯信房の開基である。

唯信房の俗姓は、人皇五十九代宇多天皇の後胤敦実親王の末孫佐々木四郎高綱の三男で左衛門尉源高重といった。

１２１８年、高重３３歳の時、世の無常を観じ出離の志をいだいて稲田の草庵（笠間の西念寺）に聖人を訪ね、一向専修の法を聞信して弟子となり、法名を唯信とたまわった。その後、那珂郡小瀬の畠谷（旧緒川村、現常陸大宮市）に一宇を建て、覚念寺と名付けた。

１１代順覚の時、１５７６年８月４日の佐竹氏合戦の際、その兵火にかかり建物や什器などを全焼。１５９５年、１３代順良の時に再建されたが、１６００年１０月、藩命によって多賀郡金沢村（現在地）に移った。

１４代順永の時、藩主徳川光圀による領内巡視の際はたびたび当寺で休息され、白銀や什器などを下された。その折のご諚の趣など近臣よりの書状があったが、その後の火災で焼失してしまった。

１６９０年に除地（免税地）２石６斗９升を賜った。

１７４１年、１６代唯縝の時に大谷派から高田派に転派した。

１８３５年７月８日、火災により本堂、庫裡等を焼失し、１８３７年に再建された。しかし、１８４３年１２月１３日の隣家の火災によって本堂、庫裡、山門、鐘楼などの類焼の難に遭った。１８５０年１１月、２０代唯教の時に再建されたが、幕末の１８６４年９月１７日、水戸藩のいわゆる「おさわぎ」の際、書生党の拠点となったため兵火を受け、またも焼失した。